RNAstructure Fold Results
(Predict the lowest free energy structure and a set of low free energy structures for a sequence.)


Download All Structures: PDF PS CT
Download Individual Structures:
      Structure 1: PDF SVG PS JPEG PNG CT
      Structure 2: PDF SVG PS JPEG PNG CT
      Structure 3: PDF SVG PS JPEG PNG CT
      Structure 4: PDF SVG PS JPEG PNG CT
      Structure 5: PDF SVG PS JPEG PNG CT
      Structure 6: PDF SVG PS JPEG PNG CT
      Structure 7: PDF SVG PS JPEG PNG CT
      Structure 8: PDF SVG PS JPEG PNG CT
      Structure 9: PDF SVG PS JPEG PNG CT
      Structure 10: PDF SVG PS JPEG PNG CT
      Structure 11: PDF SVG PS JPEG PNG CT
      Structure 12: PDF SVG PS JPEG PNG CT
      Structure 13: PDF SVG PS JPEG PNG CT
      Structure 14: PDF SVG PS JPEG PNG CT
      Structure 15: PDF SVG PS JPEG PNG CT
      Structure 16: PDF SVG PS JPEG PNG CT
      Structure 17: PDF SVG PS JPEG PNG CT
      Structure 18: PDF SVG PS JPEG PNG CT
      Structure 19: PDF SVG PS JPEG PNG CT
      Structure 20: PDF SVG PS JPEG PNG CT

Command Line:
Fold PKD2_176_Tag1_TAG.fasta Fold.ct --loop 30 --maximum 20 --percent 10 --SHAPE PKD2_453_T1_176_Pos_PKD2_176_Tag1_TAG.shape --SHAPEintercept -0.6 --SHAPEslope 1.8 --temperature 310.15 --window 3