- c -

• CalculateFreeEnergy() : RNA
• CleanupIntermediateFiles() : Multilign_object
• ClearEnergies() : Thermodynamics
• ClearEnthalpies() : Thermodynamics
• closeenoughtocut() : design
• common_energies() : Multifind_object
• CommonConstructor() : Dynalign_object
• commonconstructor() : HybridRNA
• CommonConstructor() : Oligowalk_object
• construct_mb_element_array() : ProbScan
• ContainsPseudoknot() : RNA
• CopyThermo() : RNA , Thermodynamics
• CountBP() : Multilign_object